1、自然干制，是利用太陽光為熱源，以自然風為輔助進行干燥的方法，適于竹蓀、銀耳、木耳、金針菇、靈芝等品種，此法簡單、古老、投入少。加工時將菌體平鋪在竹簾上，互不擠壓，冬季需加大傾斜角度。翻曬時，要輕，防破損，一般要2～3天才能曬干。此法適于小規模加工。有的加工廠為節約費用，等曬至半干后，再進行機械烘烤，但這需根據天氣狀況、菌體含水量等情況靈活掌握，要防止菇體變形、變色甚至腐爛。
2、機械干制，是用烘箱、烘籠、烘房，或用炭火熱風、電熱以及紅外線等熱源進行烘烤，使菌體脫水干燥的方法。目前大量使用的是直線升溫式烘房、回火升溫式烘房及熱風脫水烘干機、蒸氣脫水烘干機、紅外線脫水烘干機等。
食用菌脫水干燥的工藝多種多樣,以香菇為例，為使菇型圓整、菌蓋卷邊厚實、菇褶色澤鮮黃、香味濃郁、含水量達到12%的出口標準，必須把握好以下環節：
一、采摘、裝運。要在八成熟、未開傘時采摘，這時孢子還未散發，干制后香味濃郁、質量上乘；采前禁止噴水，采下后放在竹籃內。
二、攤晾、剪柄。鮮菇采后要及時攤放在通風干燥場地的竹簾上，加快菇體表層水分蒸發。攤晾后，按市場要求，一般按不剪柄、菇柄剪半、菇柄全剪三種方式分別進行處理，同時清除木屑等雜物及碎菇。
三、分級、裝機、烘烤。要求當日采收，當日烘烤。將鮮菇按大小、厚薄、朵形等整理分級，菇柄朝上均勻排放于上層烘簾，質量稍差的下層排放。為防止在烘烤過程中香菇細胞新陳代謝加劇、造成菇蓋伸展開傘、色澤變白、降低品質，在鮮菇進機前，可先將空機增溫到38～40℃，再排菇上架。
四、掌握火候。采后香菇含水量高達90%，此時切不可高溫急烘。開機操作務求規范：在點火升溫的同時，啟動排風扇，使熱源均勻輸入烘房。待溫度升到35～38℃時，將擺好鮮菇的烘簾分層放入烘房，促使菇體收縮，增加卷邊程度及菇肉厚度，提高于菇品質。烘房溫度控制：第1～4小時保持38～40℃，第4～8小時保持40～45℃，第8～12小時保持 45～50℃，第12～16小時保持50～53℃，第17小時保持55℃，第18小時至烘干保持60℃。
五、注意排濕、通風。隨著菇體內水分的蒸發，烘房內通風不暢會造成濕度升高，導致色澤灰褐、品質下降。操作要求：第1～8小時打開全部排濕窗，第8～12小時通風量保持50%左右，第10～15小時通風量保持30%，第16小時后，菇體已基本干燥，可關閉排濕窗。 用指甲頂壓菇蓋感覺堅硬并稍有指甲痕跡、翻動嘩嘩有聲時，表明香菇干度已夠，可出房、冷卻、包裝、貯運。
